發(fā)布日期：2017-02-08

癌癥的臨床表型（腫瘤等級(jí)等）和細(xì)胞表型（形狀等）與基因表達(dá)之間的關(guān)聯(lián)是癌癥病理的基礎(chǔ)，但是其中的機(jī)制并不是十分清楚。最近發(fā)表的一項(xiàng)研究利用影像大數(shù)據(jù)方法，建立了一張地圖化的“形狀/基因網(wǎng)絡(luò)”，用來(lái)描述癌細(xì)胞形狀與其基因表達(dá)之間的關(guān)系。  

乳腺癌是女性最常見(jiàn)的惡性腫瘤之一，是乳腺上皮細(xì)胞在多種致癌因子的作用下發(fā)生基因突變和/或表觀遺傳的改變而導(dǎo)致的細(xì)胞增殖失控。對(duì)其表觀遺傳機(jī)制的研究是目前研究的熱點(diǎn)和難點(diǎn)之一。

近期，一項(xiàng)研究利用大數(shù)據(jù)分析方法發(fā)現(xiàn)了一種細(xì)胞形狀/基因網(wǎng)絡(luò)。該研究揭示了一種新的疾病發(fā)展方向，將乳腺癌研究進(jìn)展加速推進(jìn)了“數(shù)十年”，將有可能為將來(lái)更優(yōu)的治療方法奠定基礎(chǔ)。

Genome Research上發(fā)表的這項(xiàng)研究表明，由Cancer Research（癌癥研究）資助的科學(xué)家們創(chuàng)建了一張“地圖”，它可以將乳腺癌細(xì)胞的形狀與基因的開(kāi)啟和關(guān)閉聯(lián)系起來(lái)，并與真實(shí)的疾病結(jié)果相匹配。

在這一開(kāi)創(chuàng)性的方法中，他們使用從數(shù)百萬(wàn)的影像圖片中得到的大量數(shù)據(jù)繪制出了一張地圖化的網(wǎng)絡(luò)，用于映射細(xì)胞形狀與基因之間的關(guān)系?？茖W(xué)家們從映射關(guān)系中發(fā)現(xiàn)由腫瘤的物理壓力導(dǎo)致的細(xì)胞形狀變化被轉(zhuǎn)化為基因活性的變化，并且這些變化與患者的臨床結(jié)果相關(guān)。

研究人員還確定了網(wǎng)絡(luò)內(nèi)作為信息流動(dòng)的樞紐來(lái)控制許多其他基因水平的關(guān)鍵區(qū)域或“站點(diǎn)”。

Cancer Research研究所內(nèi)動(dòng)態(tài)細(xì)胞系統(tǒng)團(tuán)隊(duì)的負(fù)責(zé)人Chris Bakal博士說(shuō)：“我們的研究揭示了作用于癌細(xì)胞的力量與疾病進(jìn)展之間的一種令人興奮的聯(lián)系。

“利用‘大數(shù)據(jù)’方法，我們?cè)趲讉€(gè)月內(nèi)就完成了原本可能需要幾十年時(shí)間的復(fù)雜分析。我們已創(chuàng)建的關(guān)于細(xì)胞形狀及其對(duì)基因活性影響的地圖為新的癌癥治療方法提供了重要指標(biāo)，也為現(xiàn)有的治療方法提供了更有效的方法”。

Cancer Research UK的首席科學(xué)家Karen Vousden教授補(bǔ)充說(shuō)：“本研究中使用的見(jiàn)解和方法將能夠讓我們從外表就知道癌癥的侵襲性和傳播的可能性，從而幫助醫(yī)生選擇和制定最好的治療方案。”

這項(xiàng)研究強(qiáng)調(diào)了表型數(shù)據(jù)的重要性，它能夠幫助我們更好地在分子、細(xì)胞和組織的水平上來(lái)了解乳腺癌的發(fā)生情況。

來(lái)源：PharmaTimes